ギャー！
fgetcsvの罠にはまってしまって、だいぶ時間をロスしてしまった。
php-devにまったく同じ問題を発見。
[PHP-dev 868]fgetcsvてゆーか、ファイル入出力の、5cの罠
fgetcsvに、内部コードがSJISのファイルを、食わせた場合。"機能",
なんてデータがあると
本来は、「機能」だけが、抽出されるべきところ
能の、2バイト目が、5chなので、エスケープされて機能",までが、データとして読み込まれてしまいます。
んがっ！
一度EUCに変換してファイルに落として、再びfgetcsvするしかない・・・（ふがふが